¿Cómo obtener los datos abiertos de GBIF?

La Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad (GBIF) es una red internacional de países y organizaciones para permitir el acceso libre y abierto a los datos sobre biodiversidad de todas las fuentes, y para apoyar la investigación científica sobre la biodiversidad, la investigación ambiental y la toma de decisiones basadas en evidencia.

Hay dos formas de acceder a los datos publicados en GBIF:

  1. A través del sitio WEB GBIF.org no requiere experiencia de programación y permite búsquedas rápidas y fáciles, filtrar y descargar funciones para datos mediados por GBIF, así como una gama de herramientas y métricas adicionales que no están disponibles a través de servicios API.
  2. A través de la API Application Programming Interface (API): permiten el acceso continuo a datos mediados por GBIF a través de otros sistemas y pueden ser la base para el desarrollo de herramientas que permitan la consulta sobre los datos.

Algunos ejemplos incluyen un número de paquetes R, como rgbif y CoordinateCleaner, así como herramientas más especializadas que permiten casos de uso más específicos, como GeoCat para evaluaciones de Listas Rojas.

👍 Recuerda que como usuario de datos, debes leer y aceptar los términos del GBIF Acuerdo de Uso de Datos que incluyen cómo citar correctamente el uso de datos mediados por GBIF.

 

Datos disponibles

Datos primarios de biodiversidad – datos de ocurrencias, listas de especies y eventos de muestreo que se proporcionan a los usuarios a través de uno de los 3 formatos de descarga:

  • Simple: CSV valores delimitados por coma. Solo contiene los datos después de la interpretación de GBIF. No incluye multimedia.
  • Archivo Darwin Core: Archivo Darwin Core (DwC-A) contiene tanto los datos originales tal como los proporcionó el publicador como la interpretación de GBIF. Solo enlaces a multimedia incluidos.
  • Lista de especies: CSV valores delimitados por coma, con la lista de nombres distintos incluidos en el resultado de la búsqueda y como una visualización en mapa de los datos.

Se proporciona una serie de métricas para países y regiones, publicadores, conjuntos de datos y búsquedas que proporcionan desglose taxonómico, tendencias en la recolección de datos y destacan problemas de calidad de datos. Para los países, estas métricas también se pueden descargar como un informe de actividad en formato PDF.

Base de datos de publicaciones que han utilizado datos mediados por GBIF para consultar.

Las búsquedas se pueden realizar sobre registros biológicosespeciesconjuntos de datospublicadores y recursos, y cada función de búsqueda lleva un conjunto de filtros que permiten una búsqueda más refinada y datos adicionales asociados con los datos, por ejemplo, imágenes, puede encontrarse en pestañas asociadas a la búsqueda.

 

Referencia:

Raymond M, Rodrigues A & Russell L A. Curso de introducción a GBIF Primera edición. Secretariado de GBIF: Copenhague. https://doi.org/10.35035/ce-fcmk-aq49.